More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3451 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  100 
 
 		 176 aa  353  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  66.1 
 
 		 177 aa  244  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0424  50S ribosomal protein L10  52.87 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000721465  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0847  ribosomal protein L10  52.57 
 
 		 173 aa  174  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3171  50S ribosomal protein L10  53.75 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00035  putative 50S ribosomal protein L10  48 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1398  50S ribosomal protein L10  47.51 
 
 		 181 aa  165  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0392  50S ribosomal protein L10  44 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1941  50S ribosomal protein L10  45.86 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  40.68 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1708  ribosomal protein L10  44.03 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0962108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  38.75 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  35.96 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 172 aa  91.3  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  33.93 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  27.84 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  32.9 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  30.86 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  29.21 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  29.21 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  27.27 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  29.83 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  35.8 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  29.55 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  32.64 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  30.94 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  30.11 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  30.2 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  33.15 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  28.41 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  32.16 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  29.38 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  31.1 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  31.1 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  26.44 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  29.88 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  29.88 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  27.27 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  30.9 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  30.9 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  27.84 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  28.32 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  29.49 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  28 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  28 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  28 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  29.73 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  30.67 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  27.91 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  29.3 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  29.8 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  28.66 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  28.75 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  28.75 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  25.75 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  28.41 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  28.18 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  28.74 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  35.38 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  27.07 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  27.92 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  31.11 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  29.73 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  25.3 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  28.16 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  27.67 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  26.86 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  26.26 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  29.8 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  29.8 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0412  50S ribosomal protein L10P  29.86 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3448  ribosomal protein L10  27.89 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000199113  hitchhiker  0.00604494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  26.71 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  32.7 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  27.54 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4326  50S ribosomal protein L10  29.86 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000437071  unclonable  0.0000000000820773 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  26.01 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  30.91 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  26.09 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  26.4 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>