221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0755 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  51.82 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  58.06 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  49.56 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  49.56 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  41.51 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  42.24 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  45.22 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  50.53 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  45.79 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  40.86 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  29.13 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  38.14 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  39.22 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  34.69 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  32.11 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  33.96 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  31.96 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  38.14 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  30.28 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  42.25 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  34 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  34.09 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  34.09 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  31.19 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  40.54 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  32.65 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  38.96 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  44.44 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  44.44 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  37.76 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  44.44 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  32.95 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  42.42 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  34.74 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  40.91 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  50 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  46.03 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  53.06 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  43.66 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  34.86 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  41.79 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  40.91 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  34.62 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  32.98 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  39.19 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  48.08 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  41.89 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  38.57 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  48.98 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  32.56 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  40.58 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  30.7 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  44.44 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  30.19 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  37.14 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  34.95 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  34.95 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  42.67 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  34.95 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  33 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  29.7 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  43.64 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  45.28 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  55.1 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  48.98 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  37.18 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  40.28 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  31.58 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  42.86 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  30.28 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  36.62 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  32.22 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  36.62 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  28.95 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  41.67 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  31.37 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  45.1 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  48.08 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  33.77 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  35.21 
 
 		 279 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  38.1 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  30.43 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  32.08 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  31.07 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  40.98 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  48.08 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  33.77 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  48.08 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  33.77 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  48.08 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  36.08 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  48.08 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  33.77 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  30.43 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>