More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1321 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1321  alpha amylase all-beta  100 
 
 		 679 aa  1420    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.475758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0847  alpha amylase all-beta  41.64 
 
 		 684 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1345  glycogen branching protein  38.81 
 
 		 672 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00189715  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_002950  PG1793  1,4-alpha-glucan branching enzyme  39.1 
 
 		 668 aa  453  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0990  alpha amylase all-beta  39.04 
 
 		 654 aa  453  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1751  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.04 
 
 		 678 aa  441  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.913589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0205  1,4-alpha-glucan branching enzyme  35.42 
 
 		 662 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.119516  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0145  1,4-alpha-glucan branching enzyme  37.21 
 
 		 647 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02314  1,4-alpha-glucan-branching enzyme (EC 2.4.1.18)(Glycogen-branching enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9Y8H3]  35.07 
 
 		 684 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.891119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31320  predicted protein  37.09 
 
 		 751 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00613314  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03810  1,4-alpha-glucan branching enzyme, putative  34.11 
 
 		 682 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88710  alpha-1,4-glucan branching enzyme  33.62 
 
 		 701 aa  362  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314091 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45076  predicted protein  33.58 
 
 		 710 aa  335  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0841943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  27.18 
 
 		 659 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  29.41 
 
 		 1320 aa  194  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  27.11 
 
 		 659 aa  194  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1051  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.61 
 
 		 670 aa  192  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  28.57 
 
 		 746 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  28.19 
 
 		 643 aa  189  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.17 
 
 		 732 aa  187  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.91 
 
 		 735 aa  187  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.5 
 
 		 728 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.96 
 
 		 639 aa  185  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.74 
 
 		 731 aa  185  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  29.49 
 
 		 1224 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  29.63 
 
 		 737 aa  184  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  28.12 
 
 		 765 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.08 
 
 		 734 aa  180  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  27.7 
 
 		 1240 aa  180  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  26.26 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  26.47 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  28.05 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  29.1 
 
 		 727 aa  177  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  27.29 
 
 		 736 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.46 
 
 		 646 aa  177  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  28.43 
 
 		 735 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.93 
 
 		 723 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.43 
 
 		 747 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  29.5 
 
 		 729 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  27 
 
 		 736 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28 
 
 		 743 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  29.87 
 
 		 729 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  30.49 
 
 		 742 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  28.03 
 
 		 728 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.77 
 
 		 736 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  26.68 
 
 		 736 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  27.05 
 
 		 737 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.48 
 
 		 721 aa  173  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.16 
 
 		 957 aa  173  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  27.5 
 
 		 736 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.9 
 
 		 731 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  27.42 
 
 		 749 aa  172  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.17 
 
 		 741 aa  172  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.75 
 
 		 654 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  26.23 
 
 		 645 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  26.67 
 
 		 723 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.87 
 
 		 674 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.4 
 
 		 822 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  28.86 
 
 		 740 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  31.33 
 
 		 755 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  27.22 
 
 		 748 aa  172  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  25.87 
 
 		 765 aa  171  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  26.79 
 
 		 736 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  27.99 
 
 		 782 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  27.99 
 
 		 782 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  28.39 
 
 		 741 aa  171  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  27.73 
 
 		 750 aa  170  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  26.08 
 
 		 759 aa  170  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  29.5 
 
 		 722 aa  170  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.62 
 
 		 741 aa  170  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  29.84 
 
 		 812 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  24.81 
 
 		 645 aa  170  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  24.81 
 
 		 645 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  27.27 
 
 		 748 aa  169  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  37.06 
 
 		 759 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.71 
 
 		 732 aa  169  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  37.06 
 
 		 759 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  26.14 
 
 		 774 aa  168  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  29.74 
 
 		 785 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  26.59 
 
 		 740 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  25.78 
 
 		 754 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  26.14 
 
 		 766 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.73 
 
 		 659 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0246  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.69 
 
 		 839 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  24.66 
 
 		 645 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  26.29 
 
 		 754 aa  167  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.4 
 
 		 726 aa  167  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  24.85 
 
 		 645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  26.98 
 
 		 732 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03850  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  27.84 
 
 		 776 aa  166  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.914445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  27.5 
 
 		 725 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  24.85 
 
 		 645 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  24.7 
 
 		 645 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  24.85 
 
 		 637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.33 
 
 		 659 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.33 
 
 		 659 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  24.7 
 
 		 645 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  24.93 
 
 		 648 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  24.96 
 
 		 674 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.09 
 
 		 732 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>