296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3611 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  80.13 
 
 		 311 aa  501  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  76.25 
 
 		 303 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  73.42 
 
 		 303 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  59.6 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  59.73 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  46.64 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  45.73 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  42.05 
 
 		 301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  46.62 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  42.86 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  37.67 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  39.74 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  42.81 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  39.4 
 
 		 304 aa  215  9e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  41.61 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  40.14 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  39.27 
 
 		 310 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  34.09 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  32.32 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  31.21 
 
 		 323 aa  148  9e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  32.35 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  28.62 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  29.81 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  30.65 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  30.2 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  29 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  29.47 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  30.62 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  30.46 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  30.46 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  29.41 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  28 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  29.28 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  31.16 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  28.71 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  30.45 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  28.05 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  30.19 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  29.17 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  29.43 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  30.69 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  29.39 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  30.45 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  31.09 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  30.13 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  28.14 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  26.4 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  27.58 
 
 		 326 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  26.8 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  25.29 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  25.17 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  24.77 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  28.85 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  25.68 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  24.32 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  28.12 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  26.34 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  27.19 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  30.73 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  29.17 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  30.73 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  26.53 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  26.79 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  26.92 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  26.29 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  25.89 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  25.89 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  25.89 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  26.46 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  26.46 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  24.31 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  26.91 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  25.66 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  25.99 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  26.34 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  26.36 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  25.68 
 
 		 244 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  26.29 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  28.37 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  26.07 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  29.79 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  25.22 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  25.22 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0101  C32 tRNA thiolase  24.69 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  24.55 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  24.68 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  25.22 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  25.22 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  25.53 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  25.22 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  24.55 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>