More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0849 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0849  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
701 aa  1405    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732792  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3043  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 
678 aa  555  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0661  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.56 
 
 
686 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1993  histidine kinase  37.66 
 
 
696 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.124604  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2196  histidine kinase  41.93 
 
 
684 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2325  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
681 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1941  sensor histidine kinase  37.63 
 
 
677 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
690 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2444  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
695 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2439  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
690 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
693 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0703  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
703 aa  183  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1598  histidine kinase  28.25 
 
 
689 aa  179  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
711 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
688 aa  171  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 
712 aa  170  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 
680 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3296  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
672 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.593293  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
694 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3103  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
688 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2437  sensor histidine kinase  24.82 
 
 
704 aa  157  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166276  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0158  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
684 aa  154  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1534  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
688 aa  150  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.887236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2672  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 
659 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0528368  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0429  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.63 
 
 
690 aa  147  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0815441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5031  sensor histidine kinase  23.13 
 
 
677 aa  146  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0949  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
706 aa  145  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317535  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1998  Signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
694 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.689731  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 
697 aa  137  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3440  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
708 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184047  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03285  sensor histidine kinase  22.18 
 
 
675 aa  127  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28 
 
 
747 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28 
 
 
747 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  32.64 
 
 
627 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 
780 aa  95.1  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.08 
 
 
747 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
631 aa  94  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
634 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.36 
 
 
752 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 
1016 aa  93.6  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
634 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  28.57 
 
 
787 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.12 
 
 
452 aa  92.8  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
638 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
627 aa  92  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
627 aa  90.9  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
501 aa  90.9  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
372 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  27.35 
 
 
598 aa  89.7  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.79 
 
 
598 aa  88.6  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
451 aa  89  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2459  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
514 aa  87.8  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  27.88 
 
 
487 aa  87  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
623 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
592 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
725 aa  85.1  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
671 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
601 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  28.73 
 
 
630 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
601 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0515  histidine kinase  28.7 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.80747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  29.18 
 
 
617 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
534 aa  84.7  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
592 aa  84.7  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
463 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  31 
 
 
705 aa  84  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
654 aa  84  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  28.88 
 
 
600 aa  84  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.81 
 
 
860 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
526 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
540 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
519 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
416 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
631 aa  82.4  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  25.11 
 
 
367 aa  82  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  29.1 
 
 
522 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  26.55 
 
 
620 aa  82  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  26.52 
 
 
1710 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 
748 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  28.33 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  26.32 
 
 
622 aa  80.9  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  27.16 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5069  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
748 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
512 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
491 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  29.63 
 
 
382 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  27.35 
 
 
391 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.52 
 
 
547 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
618 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.76 
 
 
457 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
635 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
595 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
457 aa  80.5  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
492 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
653 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
581 aa  80.1  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
780 aa  80.1  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
679 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
683 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>