More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2141 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  63.93 
 
 		 440 aa  655    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  76.02 
 
 		 470 aa  778    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  1001    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  63.8 
 
 		 441 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  61.48 
 
 		 438 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  61.48 
 
 		 438 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  60.86 
 
 		 440 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  59.51 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  60.37 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  60.37 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  60.37 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  60.37 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  60.57 
 
 		 439 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  58.57 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  58.57 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  58.57 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  58.57 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  58.57 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  58.57 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  58.57 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  58.57 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  59.78 
 
 		 410 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  58 
 
 		 419 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  46.31 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  34.88 
 
 		 446 aa  292  9e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  42.23 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  42.23 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  42.23 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  42.23 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  39.45 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  39.78 
 
 		 431 aa  263  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  36.51 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  38.6 
 
 		 430 aa  262  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  40.92 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  40.92 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  40.92 
 
 		 431 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  40.35 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  40.52 
 
 		 418 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  40.52 
 
 		 438 aa  256  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  39.88 
 
 		 423 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  40.24 
 
 		 424 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  36.76 
 
 		 439 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  38.82 
 
 		 404 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  38.52 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  37.63 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  38.48 
 
 		 428 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  30.87 
 
 		 470 aa  229  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  32.79 
 
 		 482 aa  227  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  35.31 
 
 		 512 aa  223  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  31.62 
 
 		 475 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  30.58 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  33.52 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  37.38 
 
 		 353 aa  217  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  36.68 
 
 		 550 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  35.16 
 
 		 433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  30.1 
 
 		 468 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  34.2 
 
 		 475 aa  216  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  30.51 
 
 		 491 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  35.26 
 
 		 429 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  29.81 
 
 		 468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  29.96 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  29.69 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  30.38 
 
 		 462 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  29.36 
 
 		 491 aa  210  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  30.45 
 
 		 466 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  34.97 
 
 		 436 aa  206  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  36.03 
 
 		 507 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  29.84 
 
 		 466 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  33.91 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  29.18 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  32.39 
 
 		 490 aa  203  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  33.16 
 
 		 468 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  33.83 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.84 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  31.71 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  34.76 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.67 
 
 		 473 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.8 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  34.76 
 
 		 473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  31.18 
 
 		 475 aa  191  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  29.01 
 
 		 498 aa  190  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  31.46 
 
 		 474 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  31.63 
 
 		 503 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  31.11 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  32.96 
 
 		 470 aa  176  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.19 
 
 		 480 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.9 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  30.02 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  32.36 
 
 		 479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  27.37 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  29.43 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  31.03 
 
 		 471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  27.11 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  30.75 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  30.1 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3418  peptidase M23B  36.71 
 
 		 245 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  31.32 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4303  peptidase M23B  38.1 
 
 		 245 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.616883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0266  peptidase M23B  38.1 
 
 		 245 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  37.23 
 
 		 328 aa  161  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>