95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1376 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1376  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
439 aa  874    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.757312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0639  major facilitator transporter  52.08 
 
 
437 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0640  major facilitator transporter  49.52 
 
 
425 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  29.43 
 
 
434 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 
442 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25.08 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0333  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  30.2 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
441 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.8 
 
 
442 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  21.28 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  33.91 
 
 
422 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
437 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.93 
 
 
445 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.01 
 
 
420 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
431 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
421 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25 
 
 
459 aa  53.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  23.12 
 
 
430 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  26.32 
 
 
427 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.27 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.06 
 
 
408 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  24.76 
 
 
439 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  28.63 
 
 
433 aa  50.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  25.14 
 
 
184 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  27.78 
 
 
486 aa  50.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
472 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
452 aa  50.1  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
442 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  26.19 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  20.95 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
439 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  24.12 
 
 
436 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  20.46 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  24.28 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  28.49 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  28.49 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25.3 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.94 
 
 
408 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  27.17 
 
 
444 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  28.52 
 
 
435 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  27.91 
 
 
444 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.51 
 
 
445 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  27.75 
 
 
444 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.51 
 
 
445 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  26.44 
 
 
427 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  27.75 
 
 
444 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  27.75 
 
 
444 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  27.98 
 
 
422 aa  46.6  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 
431 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  27.17 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
428 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  27.17 
 
 
446 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  23.72 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  27.84 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  35.06 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  26.59 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  30.88 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  25.69 
 
 
414 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  31.96 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.7 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  35.79 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  31.96 
 
 
429 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  26 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  25.44 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
433 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
446 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  24.7 
 
 
452 aa  44.3  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  25.86 
 
 
427 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
441 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  31.9 
 
 
436 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  19.88 
 
 
410 aa  43.9  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  25.86 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  25.86 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  25.86 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  25.86 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  25.86 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 
417 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  24.82 
 
 
444 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  34.18 
 
 
457 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  25.86 
 
 
427 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  22.22 
 
 
431 aa  43.1  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
422 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>