More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3989 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  86.59 
 
 
246 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  73.17 
 
 
246 aa  359  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  63.18 
 
 
262 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  61.51 
 
 
257 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  58.97 
 
 
254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  59.58 
 
 
255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  61.28 
 
 
251 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  60.52 
 
 
250 aa  285  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  61.7 
 
 
251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  61.18 
 
 
247 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  62.45 
 
 
251 aa  280  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  55.79 
 
 
256 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  58.3 
 
 
249 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  59.15 
 
 
255 aa  278  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  63.3 
 
 
251 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  58.3 
 
 
249 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  58.9 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  61.09 
 
 
253 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  61.09 
 
 
260 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
262 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  58.65 
 
 
247 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  59.67 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  55.87 
 
 
254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  60.25 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  59.67 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  59.67 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  56.15 
 
 
265 aa  268  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
255 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
255 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  60.25 
 
 
253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  60.67 
 
 
258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  59.41 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  57.61 
 
 
269 aa  265  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  58.85 
 
 
258 aa  265  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  58.58 
 
 
255 aa  264  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  59.32 
 
 
252 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  55.14 
 
 
268 aa  261  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  55.56 
 
 
257 aa  261  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  54.62 
 
 
249 aa  261  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 
260 aa  261  8e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  54.62 
 
 
249 aa  257  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  58.26 
 
 
255 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  56.19 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  57.2 
 
 
269 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  53.28 
 
 
247 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  53.28 
 
 
247 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  52.19 
 
 
238 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  52.19 
 
 
238 aa  217  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  52.19 
 
 
238 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  53.36 
 
 
252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  51.63 
 
 
234 aa  211  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  58.38 
 
 
246 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6153  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.85 
 
 
342 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798522  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  51.72 
 
 
340 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301256  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.72 
 
 
337 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.99 
 
 
339 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.22 
 
 
368 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
543 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  50.87 
 
 
308 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  50.21 
 
 
543 aa  205  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0756  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.88 
 
 
320 aa  205  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.288444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0457  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 
321 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  50 
 
 
276 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3117  ABC type ATPase  49.56 
 
 
331 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0682716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.31 
 
 
329 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.14 
 
 
355 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.36 
 
 
571 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3820  ABC transporter related  47.03 
 
 
277 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.925873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.7 
 
 
332 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  48.09 
 
 
544 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  48.09 
 
 
544 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  47.37 
 
 
572 aa  201  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.95 
 
 
347 aa  201  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.56 
 
 
478 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  49.17 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  46.62 
 
 
539 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 
571 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  48.56 
 
 
575 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.47 
 
 
344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.47 
 
 
344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0219399 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.64 
 
 
327 aa  199  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2551  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 
322 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  48.39 
 
 
571 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  48.09 
 
 
544 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  45.9 
 
 
602 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  48.12 
 
 
547 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
308 aa  198  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0559  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 
340 aa  198  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.98385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 
308 aa  198  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2254  oligopeptide ABC transporter, ATPase component  40.87 
 
 
322 aa  198  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  44.49 
 
 
332 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  44.49 
 
 
332 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
292 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1667  ABC transporter related  47.6 
 
 
283 aa  197  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  44.58 
 
 
559 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  44.4 
 
 
566 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>