218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0768 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  100 
 
 
219 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  55.25 
 
 
227 aa  254  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  55.25 
 
 
227 aa  254  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  55.25 
 
 
227 aa  254  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  54.79 
 
 
226 aa  252  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  54.84 
 
 
227 aa  251  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  54.38 
 
 
226 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  54.34 
 
 
227 aa  249  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  53.88 
 
 
227 aa  248  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  54.38 
 
 
227 aa  247  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  55.61 
 
 
218 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  52.53 
 
 
223 aa  231  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  49.54 
 
 
220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  51.15 
 
 
219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  47.93 
 
 
223 aa  214  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  47.93 
 
 
223 aa  214  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  48.62 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  40.36 
 
 
235 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  43.84 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  38.36 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  38.36 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  40 
 
 
224 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  39.34 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  43.19 
 
 
209 aa  151  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  42.13 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  36.41 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  42.25 
 
 
206 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  33.64 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  32.42 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  35.5 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  35.81 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  35.35 
 
 
206 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  35 
 
 
215 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  28.57 
 
 
214 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  31.63 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  28.14 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  29.38 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  30.52 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  29.44 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  29.55 
 
 
212 aa  89  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  33.01 
 
 
218 aa  89  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  27.65 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  29.58 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  31.82 
 
 
208 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  28.44 
 
 
210 aa  85.1  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  29.95 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  27.7 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  26.13 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  28.11 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27.7 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  27.7 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  27.36 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  27.7 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  27.93 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  27.7 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  26.89 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  27.36 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  31.46 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  31 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  27.72 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  27.56 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  30.77 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  31.53 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  30.23 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  26.76 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  30.77 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  31.4 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  29.31 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  28.16 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  29.09 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  29.07 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl289  DAD(P)H nitroreductase  27.18 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0826737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  28 
 
 
202 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  28.12 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  29.11 
 
 
213 aa  72  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  27.07 
 
 
211 aa  72  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.54 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  28.9 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  29.13 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  30.54 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  27.23 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  30.54 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  28.66 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  25 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  27.41 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  27.49 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  28.79 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  27.41 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  28.06 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  28.06 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  27.07 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  24.07 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  28.5 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  24.42 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  25.93 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  28.5 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  26.73 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>