76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1769 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  35.88 
 
 
139 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  28.79 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  30.82 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  31.25 
 
 
141 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  28.91 
 
 
149 aa  62.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  36.27 
 
 
133 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  29.73 
 
 
139 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  33.03 
 
 
146 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  29.55 
 
 
146 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  38.04 
 
 
142 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 
152 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  30.15 
 
 
140 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  25.71 
 
 
137 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  26.6 
 
 
130 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  25.41 
 
 
139 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  30.1 
 
 
167 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  29.52 
 
 
112 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  26.32 
 
 
145 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  25.93 
 
 
147 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  30.97 
 
 
139 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  30.33 
 
 
148 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  36.05 
 
 
137 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  27.61 
 
 
140 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  27.36 
 
 
144 aa  52.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  30.1 
 
 
163 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  25.41 
 
 
151 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  33.64 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  32.79 
 
 
152 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  29.2 
 
 
140 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  25.71 
 
 
138 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  26.67 
 
 
143 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  29.69 
 
 
146 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  25.77 
 
 
146 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  27.21 
 
 
146 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  31.76 
 
 
135 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  23.66 
 
 
135 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  27.42 
 
 
144 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  23.24 
 
 
140 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  29.82 
 
 
136 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  28.68 
 
 
140 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  27.54 
 
 
137 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  30.47 
 
 
155 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  26.67 
 
 
141 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  24.49 
 
 
143 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 
137 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  24.09 
 
 
149 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  24.24 
 
 
138 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  30.19 
 
 
241 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1600  hypothetical protein  33.04 
 
 
132 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  28.95 
 
 
145 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  23.39 
 
 
133 aa  46.2  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  27.61 
 
 
132 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  29.13 
 
 
136 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0474  hypothetical protein  30.28 
 
 
134 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.763339  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  26.39 
 
 
137 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  31.37 
 
 
162 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 
145 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  26.92 
 
 
131 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  27.21 
 
 
140 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  33.94 
 
 
140 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  27.62 
 
 
148 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  22.79 
 
 
139 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  30.94 
 
 
148 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  30.08 
 
 
140 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  26.45 
 
 
142 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  30.19 
 
 
123 aa  43.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  29.03 
 
 
143 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3749  hypothetical protein  31.3 
 
 
135 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  26.47 
 
 
142 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  34.52 
 
 
116 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  30.49 
 
 
131 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  23.4 
 
 
141 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>