More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0711 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  44.76 
 
 
882 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  45.66 
 
 
819 aa  700    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  44.96 
 
 
823 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
812 aa  1644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  46.04 
 
 
849 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  45.25 
 
 
824 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  51.91 
 
 
834 aa  791    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  44.53 
 
 
816 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  44.51 
 
 
824 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  45.86 
 
 
800 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  46.49 
 
 
806 aa  715    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  60.67 
 
 
839 aa  973    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  46.54 
 
 
861 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  51.66 
 
 
838 aa  794    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  46.24 
 
 
811 aa  678    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  46.68 
 
 
811 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  46.81 
 
 
846 aa  685    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  44.84 
 
 
802 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  44.18 
 
 
814 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.26 
 
 
790 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  41.9 
 
 
815 aa  627  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 
847 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 
847 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  40.44 
 
 
794 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.32 
 
 
824 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  40.75 
 
 
791 aa  616  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  40.76 
 
 
802 aa  618  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.72 
 
 
795 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  40.87 
 
 
820 aa  612  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.9 
 
 
799 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
787 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  40.27 
 
 
803 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  40.24 
 
 
803 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  40.27 
 
 
803 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  42.51 
 
 
826 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  40.74 
 
 
797 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  44.14 
 
 
851 aa  598  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  40.71 
 
 
799 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  40.71 
 
 
799 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  40.59 
 
 
799 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
799 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  41.39 
 
 
787 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
807 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  40.57 
 
 
792 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  40.95 
 
 
799 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  41.48 
 
 
794 aa  579  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  40.66 
 
 
799 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  40.31 
 
 
813 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  40.02 
 
 
792 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  38.76 
 
 
791 aa  567  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  41.48 
 
 
810 aa  561  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  40.81 
 
 
818 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  44.83 
 
 
775 aa  558  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  40.22 
 
 
811 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  37.02 
 
 
796 aa  551  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  44.84 
 
 
765 aa  545  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  41.58 
 
 
805 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  43.49 
 
 
802 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
813 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
828 aa  527  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  43.4 
 
 
777 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  43.61 
 
 
830 aa  515  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  43.5 
 
 
795 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
807 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  41.8 
 
 
824 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  42.54 
 
 
760 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
807 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
807 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  43.27 
 
 
817 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  35.42 
 
 
807 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
789 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  33.37 
 
 
806 aa  464  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  35.3 
 
 
814 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  33.13 
 
 
793 aa  449  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  35.58 
 
 
806 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  38.56 
 
 
733 aa  445  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  35.41 
 
 
806 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  33.17 
 
 
817 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  34.77 
 
 
808 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  38.68 
 
 
731 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  38.41 
 
 
731 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  34.64 
 
 
809 aa  431  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  33.01 
 
 
792 aa  421  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  33.46 
 
 
797 aa  421  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  37.62 
 
 
809 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0472  heavy metal translocating P-type ATPase  31.1 
 
 
781 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  38.04 
 
 
732 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  32.24 
 
 
743 aa  412  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  36.59 
 
 
735 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  37.16 
 
 
831 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  36.53 
 
 
728 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 
794 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  37.53 
 
 
743 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  36.35 
 
 
816 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  32.48 
 
 
815 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  36.34 
 
 
814 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.07 
 
 
796 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.31 
 
 
818 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  36.28 
 
 
738 aa  399  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
732 aa  398  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>