More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0110 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0110  response regulator receiver  100 
 
 		 296 aa  606  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0241  response regulator receiver protein  44.22 
 
 		 309 aa  265  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1537  response regulator receiver protein  47.78 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.376192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2442  response regulator receiver protein  38.36 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0259595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0195  response regulator receiver domain-containing protein  36.49 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2440  response regulator receiver protein  35.89 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4510  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.078722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0280  hypothetical protein  36.27 
 
 		 287 aa  122  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0146684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2174  hypothetical protein  35.26 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0803521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 1158 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 231 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 2107 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.54 
 
 		 469 aa  86.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  34.59 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.33 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  34.33 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  34.59 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1713 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2179  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  42.11 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  34.59 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  33.83 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  33.87 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  33.7 
 
 		 544 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  33.87 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1168 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  33.08 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  33.83 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1158 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  42.11 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.53 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.83 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 1195 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  41.35 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  40.91 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  37.06 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0019  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0416556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2978  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  40.91 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.39 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1131 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2645  response regulator receiver protein  34.46 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.492308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1645  hypothetical protein  37.93 
 
 		 344 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 383 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1478 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  38.64 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.17 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1145 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 204 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  29.38 
 
 		 227 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 1954 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 1406 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.88 
 
 		 869 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1097  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  37.07 
 
 		 1170 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 1629 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1942  metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1853 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  32.79 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1165 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.15 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3596  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.76 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1155 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  37.07 
 
 		 1172 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  34.48 
 
 		 1214 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1149 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1847 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1843 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0833  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.96038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1155 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1937 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  35.77 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1155 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  32.43 
 
 		 1374 aa  76.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  35.16 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.15 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  38.64 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  31.67 
 
 		 1161 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 503 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  36.69 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1942 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 508 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>