More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0195 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0195  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  617  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0241  response regulator receiver protein  39.8 
 
 		 309 aa  235  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1537  response regulator receiver protein  38.11 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.376192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0110  response regulator receiver  36.49 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2440  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2442  response regulator receiver protein  32.19 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0259595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4510  response regulator receiver domain-containing protein  31.94 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.078722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0280  hypothetical protein  36.32 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0146684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  38.66 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  33.83 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 695 aa  76.6  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3078  CheA signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.08 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  32.23 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2174  hypothetical protein  29.41 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0803521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 121 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  35.46 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  33.87 
 
 		 129 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  30.89 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 1003 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  27.66 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.47 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5453  CheA signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 747 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  36.44 
 
 		 116 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.5 
 
 		 1177 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  35.07 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  29.69 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.25 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  31.4 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 756 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2813  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2329  response regulator receiver  24.92 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2297  CheA signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 799 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3116  two component transcriptional regulator  29.93 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202822  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.84 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.17 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.17 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  29.6 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2034  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 449 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792682  normal  0.101595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 452 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.97 
 
 		 454 aa  69.3  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 769 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  33.88 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  31.88 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1049 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  29.1 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  28.68 
 
 		 769 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  28.68 
 
 		 769 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.33 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  26.84 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 129 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  27.82 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  27.82 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 769 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 120 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  30.25 
 
 		 120 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0244  CheA signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 747 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  30 
 
 		 1127 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  30.83 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  30.16 
 
 		 229 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.4 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  27.82 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.62 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1128 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 830 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 120 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  31.11 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  30.83 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  31.11 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  29.27 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  28.7 
 
 		 769 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  31.11 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.46 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2455  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.59 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46136  normal  0.292815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>