65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5783 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  38.11 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  37.59 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.2 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.475226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.02 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  31.93 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  32.28 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  32.54 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  30.38 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  35.39 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  30.34 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  28.4 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  28.4 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  32 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.51 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  23.74 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  22.61 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  21.91 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.32 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  25.93 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  26.8 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  25.78 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  27.31 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  30.41 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.22 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  28.07 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  21.65 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  29.56 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  24.09 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  27.49 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  25.32 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  27.49 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  27.86 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  24.4 
 
 		 283 aa  45.8  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  25.21 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  26.77 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  24.89 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.19 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.9 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  25.32 
 
 		 512 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.35 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  26.42 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.79 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  20.49 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  30.48 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25.54 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  25.32 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23 
 
 		 329 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  24.18 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.94 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  29.57 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1261  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.647772  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  23.08 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  28.79 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  28.74 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>