208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4805 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  45.21 
 
 		 829 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 844 aa  1695    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  57.67 
 
 		 889 aa  929    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  44.23 
 
 		 821 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  65.12 
 
 		 836 aa  1026    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  62.7 
 
 		 641 aa  788    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  42.96 
 
 		 819 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  41.7 
 
 		 819 aa  634  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  44.44 
 
 		 813 aa  630  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  42.87 
 
 		 818 aa  593  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  38.71 
 
 		 809 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  38.04 
 
 		 809 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  37.13 
 
 		 821 aa  477  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  37.05 
 
 		 804 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  37.39 
 
 		 783 aa  449  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  36.03 
 
 		 803 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  36.52 
 
 		 779 aa  437  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.58 
 
 		 796 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  31.7 
 
 		 796 aa  429  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.58 
 
 		 796 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.7 
 
 		 796 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  31.21 
 
 		 796 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.62 
 
 		 796 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.3 
 
 		 796 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.09 
 
 		 796 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  36.62 
 
 		 789 aa  419  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.21 
 
 		 796 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  31.03 
 
 		 796 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  36.09 
 
 		 774 aa  412  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  33.89 
 
 		 810 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  33.57 
 
 		 826 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  35.99 
 
 		 770 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  34.86 
 
 		 769 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  34.67 
 
 		 787 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  34.14 
 
 		 843 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  33.21 
 
 		 829 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  34.15 
 
 		 817 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  33.49 
 
 		 854 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  33.79 
 
 		 854 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  31.86 
 
 		 821 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  33.61 
 
 		 827 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  33.62 
 
 		 827 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  31.95 
 
 		 823 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  31.83 
 
 		 823 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  32.35 
 
 		 855 aa  362  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  33.45 
 
 		 827 aa  361  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  31.18 
 
 		 806 aa  360  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  33.33 
 
 		 864 aa  356  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  32.89 
 
 		 857 aa  351  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  31.29 
 
 		 823 aa  351  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  31.36 
 
 		 903 aa  348  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  32.9 
 
 		 870 aa  344  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  28.57 
 
 		 780 aa  340  5e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  33.49 
 
 		 821 aa  330  9e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  33.93 
 
 		 856 aa  325  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  31.98 
 
 		 858 aa  321  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  30.15 
 
 		 822 aa  317  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  33.9 
 
 		 906 aa  314  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  32.8 
 
 		 872 aa  310  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  31.63 
 
 		 818 aa  307  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  30.79 
 
 		 847 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  30.32 
 
 		 847 aa  294  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  30.65 
 
 		 839 aa  288  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  28.71 
 
 		 818 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  28.94 
 
 		 807 aa  275  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  31.13 
 
 		 792 aa  272  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  25.87 
 
 		 795 aa  272  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  30.64 
 
 		 809 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  29.5 
 
 		 837 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  28.99 
 
 		 788 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  29.67 
 
 		 787 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  29.41 
 
 		 795 aa  269  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  30.28 
 
 		 837 aa  269  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  28.78 
 
 		 788 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  28.45 
 
 		 787 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  30.04 
 
 		 837 aa  267  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  30.04 
 
 		 837 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  29.91 
 
 		 823 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  29.08 
 
 		 795 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  29.91 
 
 		 837 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  29.91 
 
 		 837 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  29.91 
 
 		 837 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  27.98 
 
 		 848 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  29.42 
 
 		 803 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  29.45 
 
 		 795 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  29.26 
 
 		 816 aa  260  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  25.71 
 
 		 811 aa  258  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  26.35 
 
 		 810 aa  258  5e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  29.06 
 
 		 795 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  28.78 
 
 		 824 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  28.31 
 
 		 824 aa  254  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  29.33 
 
 		 782 aa  250  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  30.05 
 
 		 785 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  26.92 
 
 		 808 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  28.69 
 
 		 809 aa  240  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  28.69 
 
 		 809 aa  240  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  31.14 
 
 		 762 aa  238  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  27.66 
 
 		 812 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  28.22 
 
 		 786 aa  234  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  28.3 
 
 		 847 aa  234  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>