More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4402 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
212 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  48.1 
 
 
211 aa  184  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  40.76 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  38.35 
 
 
213 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
208 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 
207 aa  121  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  38.65 
 
 
213 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.79 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  36.15 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  36.15 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  36.15 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.15 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.15 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.15 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.15 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  37.8 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.68 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
203 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.68 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.82 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 
211 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.57 
 
 
212 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 
212 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.55 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.07 
 
 
206 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.07 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.07 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.15 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.95 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.03 
 
 
206 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
210 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
213 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 
224 aa  108  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.74 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  32.55 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 
209 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.39 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.43 
 
 
209 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.92 
 
 
211 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
214 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
204 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.55 
 
 
211 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 
218 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 
207 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.21 
 
 
206 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 
203 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.21 
 
 
206 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.21 
 
 
206 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
203 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  35.88 
 
 
210 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  32.74 
 
 
218 aa  104  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 
209 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
211 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
211 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3922  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 
204 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  30.2 
 
 
205 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31 
 
 
204 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 
208 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 
201 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4986  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
209 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0538724  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.81 
 
 
206 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 
206 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3381  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
209 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5301  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  30.66 
 
 
204 aa  99.4  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  32.14 
 
 
222 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  32.14 
 
 
222 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  36.88 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.56 
 
 
206 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  39.1 
 
 
210 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.42 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  39.1 
 
 
210 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.88 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  32.14 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.6 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  31.19 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>