More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1295 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  64.26 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  63.43 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  50.17 
 
 		 323 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  47.53 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  47.83 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  46.46 
 
 		 329 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  46.13 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  45.03 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  45.79 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.51 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.51 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.89 
 
 		 355 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.44 
 
 		 339 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.76 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  47.14 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.79 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  45.24 
 
 		 329 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43.67 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.58 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.52 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  42.73 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.93 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44 
 
 		 330 aa  258  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  46.06 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  44.73 
 
 		 420 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  45.36 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.08 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  47.28 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.82 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  42.33 
 
 		 322 aa  255  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.38 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.18 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4039  hypothetical protein  42.46 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  42.37 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  41.94 
 
 		 326 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.44 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3508  hypothetical protein  44.26 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.62 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.12 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.67 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  43.62 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.93 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  43.56 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.77 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.86 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.77 
 
 		 335 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.21 
 
 		 358 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.68 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  43.08 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.63 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.48 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  42.9 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.14 
 
 		 323 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  43.09 
 
 		 334 aa  242  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  42.41 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  42.3 
 
 		 359 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  40.87 
 
 		 329 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  41.08 
 
 		 341 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.81 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.5 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.12 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  41.41 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39.94 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.64 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.68 
 
 		 338 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  39.73 
 
 		 330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  43.69 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.32 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.8 
 
 		 336 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  40.31 
 
 		 329 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.47 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.47 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.12 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.89 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  41.87 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  42.33 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.77 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  39.44 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.75 
 
 		 345 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.75 
 
 		 345 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  39.69 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.98 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.59 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  41.35 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  41.9 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  43 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  41.23 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  44.98 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.36 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.86 
 
 		 330 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1798  hypothetical protein  43.69 
 
 		 329 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.05 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.14 
 
 		 318 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  44.14 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  39.87 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.14 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>