More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1268 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1268  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0519  hypothetical protein  50 
 
 
322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515073  normal  0.0234005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0535  hypothetical protein  51.88 
 
 
309 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4192  hypothetical protein  49.09 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  40.27 
 
 
325 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  40.28 
 
 
320 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  41.3 
 
 
323 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  41.36 
 
 
328 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  38.85 
 
 
335 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  39.66 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  39.66 
 
 
323 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1767  hypothetical protein  43.4 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2191  hypothetical protein  41.03 
 
 
312 aa  212  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623802  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  38.85 
 
 
331 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.23 
 
 
345 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.23 
 
 
345 aa  205  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  37.92 
 
 
360 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  35.4 
 
 
339 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.54 
 
 
344 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  34.81 
 
 
336 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  35.35 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  37.76 
 
 
333 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  33.44 
 
 
325 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  34.01 
 
 
343 aa  185  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  33 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  33.79 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  35.84 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  35.57 
 
 
324 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.76 
 
 
329 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  35.96 
 
 
333 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  35.69 
 
 
337 aa  179  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  34.65 
 
 
356 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.99 
 
 
349 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  34.02 
 
 
344 aa  175  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.03 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.03 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  35.57 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  35.57 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  35.33 
 
 
327 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.06 
 
 
327 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  34.28 
 
 
333 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  35.33 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  34.62 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  35.55 
 
 
327 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  35.39 
 
 
336 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  33.54 
 
 
334 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  35.13 
 
 
327 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  34.63 
 
 
324 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.15 
 
 
328 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  34.55 
 
 
336 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  34.47 
 
 
331 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.93 
 
 
328 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.03 
 
 
331 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  35.47 
 
 
334 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  37.97 
 
 
339 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  30.75 
 
 
327 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  36 
 
 
334 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  32.24 
 
 
333 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  35.49 
 
 
321 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  31.37 
 
 
341 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  34.48 
 
 
328 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  36.67 
 
 
474 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  33.53 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  35.31 
 
 
322 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  35.35 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  33.68 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  33.98 
 
 
326 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  32.44 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  35.29 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  34.44 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  33.04 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  33.56 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  34.46 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  33.43 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  33.43 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  35.79 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  32.77 
 
 
331 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  32.55 
 
 
332 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  34.95 
 
 
321 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  33.22 
 
 
341 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  33.22 
 
 
344 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  34.98 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  34.43 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  33.33 
 
 
328 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  33.73 
 
 
330 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  34.66 
 
 
322 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  33.85 
 
 
326 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  33.9 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  33.53 
 
 
333 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  35.55 
 
 
330 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  32.65 
 
 
324 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  34.47 
 
 
335 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  35.43 
 
 
341 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  34.21 
 
 
330 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  33.72 
 
 
331 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  33.72 
 
 
331 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  33.11 
 
 
334 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  34.47 
 
 
324 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  31.99 
 
 
326 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  33 
 
 
304 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>