77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0909 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  86.82 
 
 		 461 aa  784    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  871    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  87.5 
 
 		 461 aa  776    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  31.15 
 
 		 491 aa  173  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  32.73 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  32.47 
 
 		 474 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  30.79 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  32.22 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 472 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 482 aa  149  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  28.44 
 
 		 490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 446 aa  99.8  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 454 aa  97.4  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 444 aa  93.2  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  26.33 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  26.87 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 469 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  24.15 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  27.86 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 388 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  20.44 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  24.88 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 392 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 485 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  22 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1312  major facilitator superfamily MFS_1  19.76 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  21.75 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2821  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 544 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501587 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  20.85 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  25 
 
 		 409 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  28.42 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>