263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2232 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
309 aa  630  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  57.62 
 
 
320 aa  352  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  55.59 
 
 
305 aa  351  8e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  49.84 
 
 
322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  49.52 
 
 
322 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  50.48 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  52.65 
 
 
314 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.62 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  37.94 
 
 
316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27331  putative O-succinylbenzoate synthase  33.45 
 
 
322 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  29.05 
 
 
323 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.29 
 
 
323 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.48 
 
 
365 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  30.18 
 
 
322 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2118  putative O-succinylbenzoate synthase  33.33 
 
 
323 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.39 
 
 
356 aa  89  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.97 
 
 
359 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  26.13 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2437  putative O-succinylbenzoate synthase  32.1 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.64 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.73 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.68 
 
 
368 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.03 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.98 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02041  putative O-succinylbenzoate synthase  25.78 
 
 
321 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.03 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  30.03 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  28.09 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  29.69 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.16 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  24.36 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  24.36 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  24.36 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  24.36 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  24.36 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  29.69 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01951  putative O-succinylbenzoate synthase  23.43 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  24.75 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  24.03 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.09 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  23.55 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  23.53 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0177  putative O-succinylbenzoate synthase  25.29 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.1 
 
 
365 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  26.39 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  27.37 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.4 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.36 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  23.03 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  30 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  26.86 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.62 
 
 
371 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.82 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.72 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.76 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  29.12 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  22.77 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.32 
 
 
366 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.52 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.61 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.2 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  27.34 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.42 
 
 
370 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.27 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  23.49 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.8 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  26.8 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.52 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.08 
 
 
370 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.89 
 
 
356 aa  60.1  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  20 
 
 
369 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  27.74 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.67 
 
 
377 aa  59.7  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  27.74 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.19 
 
 
363 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  27.74 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  26.8 
 
 
349 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  26.4 
 
 
349 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  20 
 
 
369 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  20 
 
 
369 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  27.74 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  26.87 
 
 
320 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  21.67 
 
 
346 aa  58.9  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  26.87 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.87 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  20 
 
 
369 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  26.87 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  24.32 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  20 
 
 
369 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  23.39 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  26.87 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.86 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  20 
 
 
369 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  26.87 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  20.8 
 
 
369 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  26.87 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.26 
 
 
372 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  20 
 
 
369 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>