84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1754 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1754  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 486 aa  954    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1130  secretion protein HlyD  44.03 
 
 		 481 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3039  secretion protein HlyD  40.98 
 
 		 509 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598574  normal  0.745605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0894  chromosome segregation ATPase-like protein  42.95 
 
 		 666 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0938  secretion protein HlyD family protein  28.02 
 
 		 464 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158667  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0405  membrane-fusion protein  29 
 
 		 422 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.390525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0093  membrane-fusion protein  27.4 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.149408  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6117  type I secretion adaptor protein  28.07 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2502  hypothetical protein  34.18 
 
 		 373 aa  123  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.507952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0111  hypothetical protein  31.65 
 
 		 312 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0871  hypothetical protein  23.99 
 
 		 372 aa  91.3  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  23.71 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  26.53 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  26.53 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  23.9 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2229  hypothetical protein  37.04 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.513911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.27 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  23.05 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.17 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.74 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  24.35 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  22.41 
 
 		 457 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  24.35 
 
 		 509 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  23.92 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  22.53 
 
 		 457 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.19 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3904  efflux pump membrane protein  28.18 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  21.55 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  22.16 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.81 
 
 		 494 aa  50.8  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  22.32 
 
 		 457 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  24.92 
 
 		 431 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.02 
 
 		 468 aa  50.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  24.92 
 
 		 431 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  24.92 
 
 		 431 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  24.92 
 
 		 431 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  24.92 
 
 		 431 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  24.92 
 
 		 431 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.12 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  24.43 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  20.91 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.26 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  23.99 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.16 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  23.24 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.86 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  22.69 
 
 		 498 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.04 
 
 		 509 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  21.47 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23 
 
 		 481 aa  47  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  23.79 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  27.51 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.51 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  27.17 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  27.17 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0242  secretion protein HlyD  30.48 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  27.17 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  27.17 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0328  hypothetical protein  21.3 
 
 		 466 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00489922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.13 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  22.79 
 
 		 522 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  23.47 
 
 		 515 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  21.84 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.06 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.59 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.59 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  25.73 
 
 		 429 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 		 421 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.81 
 
 		 460 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.91 
 
 		 441 aa  43.9  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  32.2 
 
 		 376 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  19.39 
 
 		 498 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  41.54 
 
 		 395 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  41.54 
 
 		 395 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  27.06 
 
 		 408 aa  43.5  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 		 490 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.68 
 
 		 480 aa  43.1  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  22.56 
 
 		 460 aa  43.1  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>