More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4016 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4016  inner-membrane translocator  100 
 
 
352 aa  667    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0610  inner-membrane translocator  53.59 
 
 
358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5041  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.76 
 
 
352 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4515  Monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 
346 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00130543  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6410  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197566  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.19 
 
 
314 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1812  inner-membrane translocator  37.05 
 
 
344 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0354893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2712  inner-membrane translocator  32.29 
 
 
362 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3344  inner-membrane translocator  34.62 
 
 
363 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  30.91 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  35.91 
 
 
324 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0680  inner-membrane translocator  35.89 
 
 
343 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0101  inner-membrane translocator  36.99 
 
 
342 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  30.53 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  32.25 
 
 
332 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3930  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
360 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.612132  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 
334 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.5 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3886  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
334 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
334 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  31.78 
 
 
350 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  33.1 
 
 
340 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  33.75 
 
 
322 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.35 
 
 
334 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.52 
 
 
328 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  31.37 
 
 
329 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 
835 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3689  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  32.14 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.82 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.7 
 
 
312 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  31.85 
 
 
333 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  33.45 
 
 
310 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.12 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  30.59 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  31.06 
 
 
331 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.88 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.85 
 
 
333 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2344  inner-membrane translocator  30.82 
 
 
352 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0936841  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
319 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  32.2 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  32.58 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  30.61 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  30.61 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  31.15 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  31.99 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  31.46 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  30.91 
 
 
315 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0764  ribose ABC transporter, permease  34.39 
 
 
349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.228645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  34.28 
 
 
355 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0843  Monosaccharide-transporting ATPase  30.51 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0808  inner-membrane translocator  31.17 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.308747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  32.18 
 
 
321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  31.82 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  32.32 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  31.9 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  31.9 
 
 
334 aa  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  31.48 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  33.04 
 
 
363 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  32.03 
 
 
330 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1594  monosaccharide-transporting ATPase  33.63 
 
 
354 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.723616  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  28.62 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.39 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  31.11 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  31.68 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  34.41 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  31.63 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  31.44 
 
 
354 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  31.87 
 
 
343 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  29.79 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  32.79 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  31.93 
 
 
327 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4659  monosaccharide-transporting ATPase  32 
 
 
331 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  32.29 
 
 
342 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  28.17 
 
 
318 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  28.17 
 
 
318 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2904  Monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 
322 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0339421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5008  Monosaccharide-transporting ATPase  33.52 
 
 
346 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
341 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  34.95 
 
 
335 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  30.91 
 
 
314 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  31.12 
 
 
309 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  33.67 
 
 
337 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  31.73 
 
 
321 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>