269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6831 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  100 
 
 
332 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  51.09 
 
 
331 aa  353  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  48.44 
 
 
342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.53 
 
 
341 aa  245  9e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  38.02 
 
 
348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  38.21 
 
 
340 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  37.38 
 
 
331 aa  225  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  38.21 
 
 
339 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  34.83 
 
 
343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  37.84 
 
 
340 aa  222  7e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  38.76 
 
 
342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  38.46 
 
 
342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  34.23 
 
 
330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  37.61 
 
 
339 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  37.5 
 
 
590 aa  212  7e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  34.94 
 
 
340 aa  210  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  37.01 
 
 
343 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  36.83 
 
 
341 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  31.56 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  35.28 
 
 
338 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.65 
 
 
334 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  31.53 
 
 
331 aa  176  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  33.72 
 
 
339 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  32.24 
 
 
339 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.33 
 
 
342 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  31.69 
 
 
342 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  32.84 
 
 
351 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  29.34 
 
 
334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  30.15 
 
 
339 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.06 
 
 
341 aa  160  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  32.73 
 
 
342 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.85 
 
 
340 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  31.67 
 
 
368 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  30.75 
 
 
335 aa  143  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  30.5 
 
 
366 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  29.46 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  30.42 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  28.83 
 
 
366 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 
336 aa  133  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  30.06 
 
 
344 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  29.69 
 
 
365 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  28.57 
 
 
338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  26.02 
 
 
337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 
329 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  29.28 
 
 
326 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  28.65 
 
 
372 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  27.84 
 
 
318 aa  123  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  28.97 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  26.88 
 
 
353 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  27.59 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  29.05 
 
 
367 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  27.84 
 
 
338 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  28.36 
 
 
338 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  28.36 
 
 
338 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.36 
 
 
338 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  27.46 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  27.76 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.36 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  29.57 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  26.87 
 
 
338 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  26.87 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  26.57 
 
 
317 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  32.81 
 
 
317 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  28.27 
 
 
321 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  28.24 
 
 
321 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  28.12 
 
 
360 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.83 
 
 
317 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  26.35 
 
 
320 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  25.38 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  26.11 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  26.37 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  24.66 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  24.11 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  25.45 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  25.44 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  27.56 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  26.15 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  25.55 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  25.08 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  22.34 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  25.53 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  25 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  25.9 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  24.18 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  25.38 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  27.02 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  24.16 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  27.84 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20791  putative carbohydrate kinase  25.15 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  24.68 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  27.8 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  25.58 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  23.17 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  21.75 
 
 
645 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  28.43 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  24.61 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  24.1 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  23.97 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  23.15 
 
 
317 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>