242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5922 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  100 
 
 		 323 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  40.14 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  31.76 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  34.32 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  32.96 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  31.23 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1095  hypothetical protein  38.04 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.377246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  27.72 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  30.45 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  30.8 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  27.95 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  27.94 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  28.78 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  29.92 
 
 		 291 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.63 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  29.55 
 
 		 392 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  28.73 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  28.73 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  28.73 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  28.73 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  28.73 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  28.73 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  28.36 
 
 		 288 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  28.36 
 
 		 288 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.95 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  27.68 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  27.74 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  27.99 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  29.48 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  28.68 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  27.57 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  25.85 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  27.61 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  27.3 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.46 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.12 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  28.1 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.12 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.8 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  23.79 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  25.51 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  24.91 
 
 		 401 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.95 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  25.08 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  24.6 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  34.39 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  37.68 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  33.76 
 
 		 388 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  23.16 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  24.42 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  23.7 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  22.76 
 
 		 349 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  23.26 
 
 		 283 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  24.1 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  25.94 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  22.64 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  29.28 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  24.91 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.42 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  24.5 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  24.48 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  25.74 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  33.12 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  23.05 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  25.74 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  23.4 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  26.76 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  32.26 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  38.54 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  39.5 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  23.92 
 
 		 414 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  23.05 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  37.23 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  29.08 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  23.39 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  23.62 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  27.62 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  27.93 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  27.93 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  25.33 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  23.96 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  27.03 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  25.5 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  20.99 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  39.08 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  23.04 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  22.73 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  22.73 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  22.73 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  23.53 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  23.82 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  24.18 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  31.39 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  22.74 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  25.98 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  24.76 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>