More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3325 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  100 
 
 		 178 aa  357  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  51.69 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  44.89 
 
 		 183 aa  151  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  36.46 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  34.76 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  36.08 
 
 		 191 aa  91.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  40.41 
 
 		 223 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  40.41 
 
 		 201 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  32.65 
 
 		 177 aa  90.9  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  39.73 
 
 		 201 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  37.84 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  36.64 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  35.29 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  35.95 
 
 		 186 aa  87.8  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  35.33 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  35.54 
 
 		 190 aa  87.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  32.12 
 
 		 190 aa  87.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  35.88 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  32.22 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  30 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  33.33 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  35.06 
 
 		 206 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  35.06 
 
 		 202 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  35.88 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  34.67 
 
 		 183 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  35.88 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  38.6 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  32.53 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  34.72 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  34.72 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  42.27 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  34.72 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  34.72 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  36.52 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  34.72 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  34.72 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  34.72 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  34.72 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  35.11 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  30.61 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  34.72 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  35.06 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  34.85 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  41.67 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.04 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  35.51 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  32.89 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  33.91 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  41.13 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  41.13 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  33.33 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  32.85 
 
 		 420 aa  78.6  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  32.64 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  33.12 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  37.5 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  40.83 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  32.24 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  30.41 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  37.01 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  30.69 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  30.77 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  31.94 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  33.54 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  33.8 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  29.89 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  32.61 
 
 		 441 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  36.64 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  37.19 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  30.46 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  36.88 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  35.88 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  35.11 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  36.88 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  30.54 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  28.06 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  36.17 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  35.11 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  33.11 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  35.11 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  36.17 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  30.86 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  35.11 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  32.09 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  35.11 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  35.11 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.88 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  35.11 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  30 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  28.98 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  31.85 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  35.11 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  31.22 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  34.03 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  31.9 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>