76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2795 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
1316 aa  2730    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.66 
 
 
612 aa  156  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  35.66 
 
 
609 aa  156  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0798  hypothetical protein  30.97 
 
 
952 aa  122  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2415  hypothetical protein  32.17 
 
 
474 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  28.81 
 
 
293 aa  95.9  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 
907 aa  82.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.12 
 
 
850 aa  79  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 
633 aa  78.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.78 
 
 
278 aa  77.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 
615 aa  74.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.48 
 
 
615 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2712  hypothetical protein  27.12 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.348645  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.88 
 
 
561 aa  71.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 
789 aa  69.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.41 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.39 
 
 
717 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.85 
 
 
979 aa  67.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  28.42 
 
 
277 aa  66.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 
288 aa  65.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.85 
 
 
719 aa  63.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.43 
 
 
265 aa  62.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  32.03 
 
 
322 aa  62.4  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.76 
 
 
275 aa  62  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.74 
 
 
491 aa  61.6  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.46 
 
 
538 aa  61.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.46 
 
 
538 aa  61.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.29 
 
 
343 aa  61.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.87 
 
 
477 aa  61.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.97 
 
 
562 aa  61.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
1196 aa  60.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.29 
 
 
302 aa  60.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  25.86 
 
 
420 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  30.19 
 
 
463 aa  60.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.78 
 
 
711 aa  59.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.78 
 
 
711 aa  59.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  28.17 
 
 
438 aa  58.9  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
464 aa  57.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
301 aa  57.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 
890 aa  58.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32 
 
 
270 aa  57.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.94 
 
 
612 aa  56.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.37 
 
 
1004 aa  57  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  28.1 
 
 
403 aa  56.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  29.61 
 
 
378 aa  56.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01632  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  29.02 
 
 
315 aa  56.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 
898 aa  56.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  30.43 
 
 
517 aa  56.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  32.52 
 
 
671 aa  56.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.84 
 
 
590 aa  55.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.37 
 
 
276 aa  54.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.78 
 
 
805 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  32.08 
 
 
404 aa  53.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.26 
 
 
313 aa  52.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.03 
 
 
666 aa  52.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.56 
 
 
658 aa  51.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
428 aa  50.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.12 
 
 
654 aa  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  25.14 
 
 
369 aa  49.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  25.23 
 
 
297 aa  49.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  29.34 
 
 
442 aa  48.9  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.78 
 
 
261 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  28.49 
 
 
292 aa  48.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.93 
 
 
316 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.09 
 
 
324 aa  47.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.63 
 
 
1004 aa  47  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.44 
 
 
324 aa  47.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0212  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  41.1 
 
 
418 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1955  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  25 
 
 
275 aa  46.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 
841 aa  46.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1383  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.81 
 
 
276 aa  46.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.627744  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  30 
 
 
540 aa  46.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.35 
 
 
278 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.87 
 
 
316 aa  45.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.36 
 
 
419 aa  45.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.5 
 
 
641 aa  45.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>