More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2016 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  53.96 
 
 		 796 aa  790    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  57.85 
 
 		 754 aa  892    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  51.98 
 
 		 798 aa  775    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  63.51 
 
 		 783 aa  963    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  53.58 
 
 		 787 aa  772    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  61.39 
 
 		 792 aa  955    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  53.65 
 
 		 770 aa  828    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  62.2 
 
 		 780 aa  929    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  67.55 
 
 		 755 aa  1063    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  55.5 
 
 		 800 aa  800    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  59.33 
 
 		 755 aa  912    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  100 
 
 		 757 aa  1563    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  79.79 
 
 		 755 aa  1264    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  72.44 
 
 		 765 aa  1131    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  79.07 
 
 		 756 aa  1226    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  75.8 
 
 		 755 aa  1184    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  70.01 
 
 		 760 aa  1108    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  75.13 
 
 		 758 aa  1164    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  61.9 
 
 		 751 aa  975    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  37.91 
 
 		 645 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  37.91 
 
 		 645 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  35.9 
 
 		 655 aa  365  2e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  35.81 
 
 		 640 aa  363  6e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  34.71 
 
 		 639 aa  360  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  35.34 
 
 		 643 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  33.98 
 
 		 642 aa  350  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  34.57 
 
 		 642 aa  350  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  37.07 
 
 		 641 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  35.21 
 
 		 642 aa  346  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  33.66 
 
 		 643 aa  343  8e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  35.04 
 
 		 641 aa  342  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  34.21 
 
 		 646 aa  340  8e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  35.44 
 
 		 644 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  35.32 
 
 		 640 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  33.24 
 
 		 642 aa  334  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  33.8 
 
 		 641 aa  333  6e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  34.53 
 
 		 648 aa  333  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  33.81 
 
 		 648 aa  330  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  33.74 
 
 		 661 aa  320  9e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  34.44 
 
 		 644 aa  320  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  32.14 
 
 		 660 aa  312  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  34.53 
 
 		 644 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  33.72 
 
 		 657 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  33.52 
 
 		 646 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  32.74 
 
 		 656 aa  303  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  34.42 
 
 		 658 aa  302  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  34.38 
 
 		 657 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  31.91 
 
 		 645 aa  299  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  32.48 
 
 		 644 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  32.28 
 
 		 648 aa  297  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  30.87 
 
 		 660 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  31.18 
 
 		 649 aa  290  7e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  30.59 
 
 		 661 aa  290  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  31.78 
 
 		 645 aa  287  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  32.24 
 
 		 668 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  30.69 
 
 		 647 aa  278  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  29.44 
 
 		 659 aa  277  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  30.48 
 
 		 656 aa  270  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  29.97 
 
 		 652 aa  267  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  32.16 
 
 		 674 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  29.63 
 
 		 883 aa  250  8e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  29.24 
 
 		 907 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  29.4 
 
 		 647 aa  246  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  29.05 
 
 		 875 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  29.09 
 
 		 891 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  29.09 
 
 		 907 aa  241  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3640  aconitate hydratase  29.09 
 
 		 907 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.593974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  29.09 
 
 		 907 aa  241  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  29.09 
 
 		 907 aa  241  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  29.09 
 
 		 907 aa  241  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  29.09 
 
 		 907 aa  241  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3627  aconitate hydratase  29.09 
 
 		 907 aa  241  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0135995 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  28.86 
 
 		 855 aa  240  8e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6080  aconitate hydratase  29.14 
 
 		 865 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.76062 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3724  aconitate hydratase  29.09 
 
 		 907 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.489907  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  28.88 
 
 		 865 aa  239  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1593  aconitate hydratase  28.97 
 
 		 907 aa  238  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02721  aconitate hydratase  28.25 
 
 		 863 aa  237  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  28.68 
 
 		 872 aa  237  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1777  aconitate hydratase  28.95 
 
 		 862 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00224724  hitchhiker  0.000953384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0235  aconitate hydratase  28.83 
 
 		 919 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163774  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0620  aconitate hydratase  30.52 
 
 		 874 aa  234  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343199  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3289  aconitate hydratase  28.82 
 
 		 866 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0578513 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3302  aconitate hydratase  28.64 
 
 		 907 aa  235  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12237  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  30.89 
 
 		 840 aa  234  4.0000000000000004e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2087  aconitate hydratase  28.42 
 
 		 862 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3947  aconitate hydratase  29.51 
 
 		 867 aa  234  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4142  aconitate hydratase  29.39 
 
 		 863 aa  233  9e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3646  aconitate hydratase  29.57 
 
 		 871 aa  233  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2497  aconitate hydratase  29.08 
 
 		 869 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4049  aconitate hydratase  29.39 
 
 		 863 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0174  aconitate hydratase 1  29.08 
 
 		 900 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0847223  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4840  aconitate hydratase  29.38 
 
 		 865 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6708  aconitate hydratase  28.45 
 
 		 870 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0343  aconitate hydratase  29.11 
 
 		 867 aa  231  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4023  aconitate hydratase  29.21 
 
 		 871 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2264  aconitate hydratase  28.99 
 
 		 907 aa  231  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1937  aconitate hydratase  28.33 
 
 		 862 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  28.59 
 
 		 864 aa  230  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3434  aconitate hydratase  28.21 
 
 		 863 aa  230  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070835  normal  0.23906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>