More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1861 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  64.86 
 
 		 224 aa  304  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  46.36 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0956  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  207  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.504019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 224 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3028  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3258  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3261  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  43.12 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2001  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3272  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0802882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  42.66 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3279  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 236 aa  177  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2949  response regulator  40.91 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.028063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3013  response regulator  41.36 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3249  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2977  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  41.47 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  41.47 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  41.47 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  41.01 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  41.01 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2385  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2431  response regulator receiver  38.64 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.721266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.28 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1953  DNA-binding response regulator  36 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.64 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3566  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.720677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  39.73 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  37.95 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  34.22 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  36.82 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  38.39 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1242  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  36.32 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.29 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.27 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  37.61 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  37.9 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  36.53 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 231 aa  147  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  36.61 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.89 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  36 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  34.72 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  33.8 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  36.89 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  38.46 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.48 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>