223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2435 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2435  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 252 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.38 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  38.79 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2054  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  36.56 
 
 		 706 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  33.94 
 
 		 539 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 236 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.86 
 
 		 1022 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  36.04 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.11 
 
 		 810 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 878 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  32.17 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  38.32 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.89 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  34.51 
 
 		 582 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40 
 
 		 988 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  33.09 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.64 
 
 		 367 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  43.21 
 
 		 706 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 649 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  45.31 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0992  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.999896  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  42.5 
 
 		 581 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.17 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.98 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  44.62 
 
 		 410 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 389 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 		 750 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.11 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 3145 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.29 
 
 		 1056 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.37 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 1827 aa  52  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 804 aa  52  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  28.33 
 
 		 164 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.19 
 
 		 818 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 373 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  35.24 
 
 		 750 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 637 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 547 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.19 
 
 		 784 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 833 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 371 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  32.22 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 762 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  45.76 
 
 		 543 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 4489 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 833 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  39.71 
 
 		 715 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 361 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.43 
 
 		 725 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  34.69 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 828 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.68 
 
 		 820 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 789 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 308 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 374 aa  49.3  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 		 547 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 178 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 718 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.94 
 
 		 289 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 289 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 187 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 828 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 605 aa  48.5  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 750 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 		 927 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 1421 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  41.27 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.47 
 
 		 632 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1060  TPR repeat-containing protein  20.69 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.51 
 
 		 875 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>