More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0509 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  234  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  69.91 
 
 		 113 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  70.87 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  67.33 
 
 		 111 aa  149  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 111 aa  147  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 111 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  66 
 
 		 111 aa  147  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  45.05 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  54.41 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  40.22 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  40.23 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  50.72 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  35.42 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  43.68 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  36.27 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  37 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  39.56 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  38.96 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  37.18 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  34.94 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  41.43 
 
 		 336 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 93 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1906  regulatory protein ArsR  36.92 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  35.9 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2393  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0242789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2996  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00129565  normal  0.033071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2201  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00183018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2140  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00329854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2123  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000110914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2328  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2363  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2382  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2463  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 110 aa  47.4  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2171  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0439276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>