61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0248 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  224  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0211  HipA N-terminal domain protein  96.26 
 
 		 107 aa  216  7e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2167  HipA N-terminal domain protein  83.18 
 
 		 107 aa  197  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0107029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0858  hypothetical protein  52.88 
 
 		 111 aa  125  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000215175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0152  HipA N-terminal domain protein  52.43 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0495  hypothetical protein  49.5 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0402  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2291  hypothetical protein  36.27 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  44.16 
 
 		 419 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  36.19 
 
 		 408 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  32.98 
 
 		 439 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  34 
 
 		 426 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  34.04 
 
 		 422 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.68 
 
 		 382 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  32.99 
 
 		 440 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  32.99 
 
 		 440 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  32.99 
 
 		 440 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  32.99 
 
 		 440 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  32.99 
 
 		 440 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  32.61 
 
 		 440 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  35.56 
 
 		 449 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  28.75 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  32.98 
 
 		 435 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  27.78 
 
 		 441 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  30.53 
 
 		 438 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  31.25 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  32.99 
 
 		 414 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  35.96 
 
 		 440 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  31.25 
 
 		 435 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  37.35 
 
 		 445 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1775  HipA N-terminal domain protein  33.67 
 
 		 404 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.474256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  31.25 
 
 		 435 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  34.78 
 
 		 434 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  29.49 
 
 		 435 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  34.78 
 
 		 434 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  34.18 
 
 		 435 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  38.89 
 
 		 439 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  29.13 
 
 		 434 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  33.71 
 
 		 440 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  36.17 
 
 		 437 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  30.28 
 
 		 450 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  35.05 
 
 		 435 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  30.21 
 
 		 446 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  35.14 
 
 		 435 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  33.02 
 
 		 443 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  28.12 
 
 		 446 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.26 
 
 		 425 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  28.87 
 
 		 450 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  33.7 
 
 		 434 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  33.7 
 
 		 434 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  31.96 
 
 		 433 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  30.77 
 
 		 430 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  35.96 
 
 		 524 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  32.29 
 
 		 445 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  35.53 
 
 		 403 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  30.11 
 
 		 449 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  37.8 
 
 		 396 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  27.72 
 
 		 441 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  29.27 
 
 		 439 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.1 
 
 		 454 aa  40  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  31.58 
 
 		 430 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>