117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1756 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1756  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 225 aa  463  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 428 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  37.84 
 
 		 470 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 428 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15451  hypothetical protein  39.19 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  38.38 
 
 		 379 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0883  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.67 
 
 		 128 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  41.38 
 
 		 503 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  41.38 
 
 		 494 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  41.38 
 
 		 493 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  41.38 
 
 		 493 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3377  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.19 
 
 		 128 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  41.38 
 
 		 493 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  41.38 
 
 		 494 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  41.38 
 
 		 504 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  42.65 
 
 		 444 aa  48.5  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  31.31 
 
 		 417 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  38.27 
 
 		 430 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  38.27 
 
 		 430 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 		 379 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  42.65 
 
 		 444 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 553 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  39.66 
 
 		 494 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  42.65 
 
 		 444 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  39.51 
 
 		 455 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  39.66 
 
 		 494 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2990  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.94 
 
 		 428 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  33.75 
 
 		 483 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  33.75 
 
 		 483 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  33.75 
 
 		 483 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  32.99 
 
 		 577 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.04 
 
 		 434 aa  46.6  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  35.44 
 
 		 435 aa  46.6  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 		 429 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1393  stage IV sporulation protein B  41.82 
 
 		 447 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  33.75 
 
 		 495 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  33.75 
 
 		 495 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  36.84 
 
 		 495 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  33.75 
 
 		 495 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  33.75 
 
 		 495 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  42.25 
 
 		 463 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  43.86 
 
 		 488 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  37.18 
 
 		 407 aa  45.8  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  42.42 
 
 		 456 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  39.02 
 
 		 377 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  38.27 
 
 		 439 aa  45.1  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0277  peptidase S41  35.29 
 
 		 447 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  40.26 
 
 		 528 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  41.94 
 
 		 537 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  35.8 
 
 		 453 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  40.74 
 
 		 494 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  34.38 
 
 		 457 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0474  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.1 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  42.86 
 
 		 489 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  36.14 
 
 		 428 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 		 449 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3796  carboxyl-terminal protease  32.35 
 
 		 1072 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  36.11 
 
 		 487 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1830  peptidase RseP  41.18 
 
 		 455 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  35 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  31.76 
 
 		 368 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  37.5 
 
 		 520 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 		 476 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.82 
 
 		 558 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  37.5 
 
 		 490 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  26.77 
 
 		 477 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2959  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.86 
 
 		 124 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000602198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  45 
 
 		 412 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  37.31 
 
 		 451 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  34.02 
 
 		 476 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  44.07 
 
 		 507 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  34.48 
 
 		 396 aa  42.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  42.37 
 
 		 502 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  36.11 
 
 		 415 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  42.37 
 
 		 502 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  42.37 
 
 		 502 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  42.37 
 
 		 502 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  42.37 
 
 		 502 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 		 423 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  34.94 
 
 		 452 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3853  carboxyl-terminal protease  32.35 
 
 		 1073 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3939  carboxyl-terminal protease  32.35 
 
 		 1073 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0122378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  42.37 
 
 		 461 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  42.37 
 
 		 485 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  42.37 
 
 		 498 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  42.55 
 
 		 436 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  42.37 
 
 		 498 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  32.79 
 
 		 501 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  42.55 
 
 		 436 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  42.37 
 
 		 498 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  36.25 
 
 		 472 aa  42.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 		 545 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1495  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.29 
 
 		 373 aa  42.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  31.19 
 
 		 412 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 491 aa  42  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  41.51 
 
 		 459 aa  42  0.007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  37.29 
 
 		 413 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  35.29 
 
 		 386 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.92 
 
 		 463 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>