More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13270 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  785    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  53.54 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  45.21 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  37.6 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  47.09 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19530  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.57 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000946719  hitchhiker  0.00000162886 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0756  NLP/P60 protein  36.46 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.640011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  25.95 
 
 		 432 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  26.96 
 
 		 432 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  23.5 
 
 		 409 aa  86.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  22.46 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.42 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  23.26 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  46.88 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  38.71 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  38.71 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  38.71 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 535 aa  79.7  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  39.18 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  38.2 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  44.33 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  22.95 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  22.01 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.21 
 
 		 556 aa  77.4  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  39.78 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  40.52 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  22.95 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  38.32 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  38.79 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  26.02 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  24.94 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  40.59 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 469 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 469 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.33 
 
 		 331 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  43.37 
 
 		 257 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 162 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  39.36 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  33.88 
 
 		 265 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  39.62 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  40.82 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  32.37 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  44.58 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  42.86 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  44.19 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  39 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  38.3 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  34.46 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  33.87 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  34.48 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  31.47 
 
 		 224 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  31.44 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 269 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  37.07 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  42.27 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  28.19 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.67 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  42.86 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  35.17 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  40.79 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  35.17 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.67 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  40.7 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  37.62 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.54 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  34.17 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  30.71 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  39.42 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  43.68 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  31.55 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  42.17 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  34.17 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  30.22 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  45.35 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  33.96 
 
 		 1048 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  29.52 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>