More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05600 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  51.83 
 
 		 197 aa  177  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  48.7 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  39.9 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.94 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.94 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  45.16 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  40.21 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  41.15 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  36.84 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  41.21 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  45.16 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  44.44 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  46.5 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  37.43 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.32 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  38.83 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.71 
 
 		 220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.71 
 
 		 220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  40.74 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  40.22 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.71 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  39.78 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.78 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.78 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.78 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.78 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  39.25 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  36.51 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  39.25 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  37.04 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  37.97 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  38.71 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  39.57 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.25 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.17 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  35.83 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  35.29 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  38.17 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.17 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.17 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.17 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  38.17 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.17 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  35.29 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  40.64 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  37.57 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  33.51 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  35.29 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  35.83 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  37.82 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.7 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  42.95 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  42.94 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  37.57 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  39.23 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  38.71 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  36.17 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.77 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.71 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  36.84 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  35.11 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  36.84 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  35.26 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  38.71 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  37.63 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.97 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  41.86 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  44.52 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  35.5 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  36.7 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  36.17 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  45.12 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  45.16 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  37.74 
 
 		 183 aa  100  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  34.04 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  39.38 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  40.83 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  40.65 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  34.76 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  40 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  35.48 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  38.61 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  36.61 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  42.28 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  39.61 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  38.71 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  40.65 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  33.51 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  33.86 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  34.22 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  36.56 
 
 		 194 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  37.1 
 
 		 179 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  38.34 
 
 		 187 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  37.63 
 
 		 179 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  40.62 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  43.2 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.52 
 
 		 202 aa  97.4  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  39.23 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>