More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2388 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2388  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 
812 aa  1666    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.27 
 
 
891 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.39 
 
 
887 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  22.58 
 
 
842 aa  164  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.75 
 
 
887 aa  158  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  24.46 
 
 
870 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.81 
 
 
840 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  22.5 
 
 
866 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  22.37 
 
 
871 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  21.39 
 
 
865 aa  128  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.81 
 
 
852 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.14 
 
 
903 aa  126  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  27.67 
 
 
781 aa  124  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  28.52 
 
 
275 aa  124  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  28.81 
 
 
825 aa  123  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  28.24 
 
 
885 aa  124  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  26.6 
 
 
366 aa  121  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.63 
 
 
902 aa  120  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  25.58 
 
 
885 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  28.24 
 
 
890 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.21 
 
 
835 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  25.8 
 
 
726 aa  115  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  25.87 
 
 
891 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  27.56 
 
 
868 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  27.56 
 
 
868 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  23.75 
 
 
963 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  26.92 
 
 
868 aa  112  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  23.47 
 
 
971 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  26.38 
 
 
906 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  27.56 
 
 
869 aa  111  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  28.21 
 
 
869 aa  111  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.69 
 
 
869 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  26.15 
 
 
758 aa  109  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.97 
 
 
821 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  26.46 
 
 
758 aa  109  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  25.7 
 
 
754 aa  109  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  26.98 
 
 
868 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  27.71 
 
 
874 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.96 
 
 
302 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.48 
 
 
867 aa  108  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  26.75 
 
 
769 aa  108  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  27.52 
 
 
334 aa  107  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  28.03 
 
 
414 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  24.52 
 
 
907 aa  107  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25 
 
 
873 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  26.15 
 
 
758 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  27.48 
 
 
868 aa  107  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.29 
 
 
950 aa  107  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  27.13 
 
 
868 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.52 
 
 
811 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  26.49 
 
 
868 aa  105  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  29.7 
 
 
826 aa  104  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  29.3 
 
 
764 aa  104  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  26.91 
 
 
868 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  27.65 
 
 
794 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  28.66 
 
 
758 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  28.32 
 
 
791 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  26.49 
 
 
788 aa  102  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  27.62 
 
 
757 aa  101  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  27.06 
 
 
795 aa  100  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  28.72 
 
 
837 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  26.76 
 
 
794 aa  99.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.93 
 
 
810 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  26.2 
 
 
761 aa  99.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  24.77 
 
 
359 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  26.22 
 
 
790 aa  98.6  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  27.97 
 
 
758 aa  98.6  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  27.69 
 
 
758 aa  98.6  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  23 
 
 
892 aa  98.6  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  27.36 
 
 
789 aa  96.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 
805 aa  97.1  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  28.34 
 
 
789 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  28.34 
 
 
789 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  28.34 
 
 
789 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  23.99 
 
 
824 aa  97.1  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  28.34 
 
 
789 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  23.23 
 
 
364 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  26.17 
 
 
779 aa  96.7  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  27.56 
 
 
795 aa  96.3  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  28.01 
 
 
789 aa  96.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30 
 
 
868 aa  96.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  24.84 
 
 
782 aa  96.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  28.01 
 
 
789 aa  96.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  28.94 
 
 
790 aa  95.5  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  27.04 
 
 
791 aa  95.5  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.45 
 
 
1097 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  25.95 
 
 
788 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  28.03 
 
 
795 aa  95.5  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  27.12 
 
 
795 aa  94.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  26.05 
 
 
868 aa  94.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  24.44 
 
 
853 aa  94.7  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  26.25 
 
 
760 aa  94.4  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  26.89 
 
 
790 aa  94  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  24.01 
 
 
758 aa  94  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  27.69 
 
 
808 aa  94.4  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  26.71 
 
 
789 aa  93.6  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  25.38 
 
 
382 aa  93.6  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.37 
 
 
692 aa  94  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.61 
 
 
889 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.92 
 
 
853 aa  93.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>