283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0720 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  253  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  55.28 
 
 
130 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  47.97 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  45.54 
 
 
116 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  50.96 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  41.82 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  42.62 
 
 
122 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  45.1 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  41.8 
 
 
123 aa  90.1  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  41.8 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  39.34 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  41.44 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  40.34 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  41.46 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  41.46 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  39.32 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  40.34 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  36.22 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  43.7 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.22 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  38.21 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  45.53 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  40.4 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  38.74 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  37.4 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  39.2 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  37.86 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  41.84 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  46 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  44.79 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  35.25 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  42.59 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  37.4 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  41.13 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  40.32 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  35.25 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  37.78 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  44.12 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  35.65 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  37.29 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  43.75 
 
 
153 aa  76.6  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  40.21 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  39.78 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  37.4 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  42.34 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  41.23 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  42.86 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  34.45 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  41.6 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  38.76 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.67 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  41.58 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  36.59 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  39.62 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  39.62 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  38.24 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  34.19 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  43.75 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  36.07 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  35.96 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  32.23 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  34.96 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  36.19 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  32.81 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  41.46 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.24 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  29.6 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  38.68 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  34.45 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  38.32 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  31.4 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  34.82 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  35.54 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  35.34 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  38.66 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  32.76 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  40.4 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  33.86 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  38.6 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  41.94 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  34.95 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  34.95 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  31.5 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  33.87 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  38.38 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  31.58 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  37.37 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  40.2 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  37.7 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  36 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  38.24 
 
 
117 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  30.65 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  33.01 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  31.4 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  34.41 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  38 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>