More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4058 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 169 aa  340  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  47.41 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  44.22 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  39.88 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 154 aa  98.2  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  36.65 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  42.24 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  42.59 
 
 		 168 aa  91.3  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  41.96 
 
 		 159 aa  90.9  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  40.24 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 199 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  46.51 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 176 aa  87.8  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  39.49 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  43.33 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  50.46 
 
 		 123 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  39.73 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  35.4 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 145 aa  84.3  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  46.03 
 
 		 174 aa  84.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 170 aa  84  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 174 aa  84  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 169 aa  84  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  40.23 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  39.51 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  39.61 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  38.18 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  42.36 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  38.18 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  40.23 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  40.56 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  45.61 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 178 aa  80.5  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  39.38 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  34.73 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  37.87 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  39.61 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>