More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2967 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2967  response regulator receiver protein  100 
 
 		 147 aa  288  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2460  response regulator receiver protein  67.23 
 
 		 131 aa  147  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732516  normal  0.518565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2461  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2343  response regulator receiver protein  45 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2787  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.058704  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3276  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2580  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4054  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.39 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1341  response regulator receiver  34.4 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  36 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1362  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2239  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 466 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1708  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.21 
 
 		 463 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.21 
 
 		 463 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3100  response regulator  33.33 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.182729  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1027  response regulator receiver  31.09 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1905  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.558841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1017  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 460 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0996419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  32.26 
 
 		 203 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5338  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890396  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  33.33 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03680  C4 dicarboxylate two-component response regulator, sigma54-dependent; DctD2  35.96 
 
 		 461 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0105245  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000815  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  34.62 
 
 		 449 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  29.84 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5291  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  29.55 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 391 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1135  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  32 
 
 		 450 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2709  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 501 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4405  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 448 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.851623  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2118  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 243 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06722  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  34.62 
 
 		 449 aa  57  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 243 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 213 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1824  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0653482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 455 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.77 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 243 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0776  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  26.55 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1058  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0191246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4728  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.63 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 		 508 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  30.7 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 799 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1743  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.961506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0332  C4-dicarboxylate transport response regulator transcription regulator protein  32.17 
 
 		 438 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0833  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 466 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.96038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0883  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.76 
 
 		 466 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1316  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0622647 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2412  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.18168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3375  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 461 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.98 
 
 		 463 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 454 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  30.89 
 
 		 451 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.35 
 
 		 466 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 678 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2406  response regulator receiver domain-containing protein  31.68 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0879  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.76 
 
 		 466 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0194  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.43 
 
 		 438 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 245 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0188  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.43 
 
 		 438 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  27.88 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5630  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  0.0327485 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 631 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0378  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 245 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.93 
 
 		 941 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0263  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.8 
 
 		 468 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal  0.0177919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  33.33 
 
 		 205 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 		 220 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3545  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 553 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.70141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>