122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2578 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  315  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  59.62 
 
 
171 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  41.22 
 
 
184 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  37.76 
 
 
197 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  45.69 
 
 
159 aa  97.1  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  40.13 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  40.13 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  37.91 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  42.31 
 
 
173 aa  91.3  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  37.88 
 
 
185 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  39.39 
 
 
165 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  43.56 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  38.89 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  32.46 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  37.04 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  37.11 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  35.29 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  32.09 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  36.08 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  34.35 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  34.31 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  35.11 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  31.91 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  33.94 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  34.11 
 
 
148 aa  61.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  29.51 
 
 
145 aa  61.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  36.84 
 
 
218 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  35 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  34.38 
 
 
137 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  31.62 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  35.11 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  28.03 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  33.86 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  29.79 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  27.56 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  31.03 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  34.02 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  33.62 
 
 
131 aa  58.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  29.27 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  24 
 
 
210 aa  58.2  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  24 
 
 
210 aa  58.2  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  24 
 
 
223 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  32.35 
 
 
106 aa  57.4  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  31.91 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  28.47 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  31.91 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  35.65 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  35.05 
 
 
195 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  30.39 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  30.4 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  30.4 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  30.6 
 
 
164 aa  53.9  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  27.64 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  34.62 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  34.02 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  31.67 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  29.09 
 
 
121 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  26.92 
 
 
133 aa  52.4  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  29.91 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  29.32 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  26.8 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  34.38 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  29.49 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  34.38 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  30.83 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  34.38 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  30.19 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  23.21 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  32.69 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  30.39 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  31.4 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  31.4 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  34.38 
 
 
122 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  30.08 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2478  hypothetical protein  28.15 
 
 
203 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  25.74 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  26.05 
 
 
220 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  31.96 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  28.44 
 
 
153 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  26.96 
 
 
133 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  31.97 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  30.83 
 
 
136 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  26.4 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  28.32 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  32.71 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  27.08 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  30.83 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  28.57 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  34.94 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  26.55 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  31.07 
 
 
220 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  28.43 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  26.32 
 
 
185 aa  44.7  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  24.76 
 
 
134 aa  44.7  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  30.77 
 
 
100 aa  44.3  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  24.51 
 
 
119 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  27.69 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  29.47 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  28.16 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  29.7 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>