197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1066 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
321 aa  631  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  30.88 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.27 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  28.45 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.55 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  26.96 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  26.96 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  26.96 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  26.73 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  23.01 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  23.43 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  24.07 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  27.62 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  26.24 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  24.17 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  26.44 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  27.62 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
353 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  33.18 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  25.96 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  26.92 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  26.92 
 
 
301 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  24.58 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.21 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.35 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.5 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
368 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  22.67 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
341 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
338 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
370 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
370 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
331 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  24.69 
 
 
341 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
321 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
368 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.45 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.809623 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  27.73 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  33.33 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
276 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  27.92 
 
 
324 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
346 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
335 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
372 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
332 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
329 aa  52.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.714533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.93 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  24.62 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.67 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  26.67 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.84 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
324 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.22 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>