More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3768 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  53.71 
 
 		 928 aa  954    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  43.35 
 
 		 862 aa  733    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 		 858 aa  724    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 871 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  66.14 
 
 		 1088 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  41.71 
 
 		 858 aa  738    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 		 900 aa  668    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 		 870 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41.59 
 
 		 870 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 968 aa  1939    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 		 858 aa  715    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  66.07 
 
 		 1085 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 		 896 aa  675    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  39.9 
 
 		 887 aa  701    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  43.69 
 
 		 898 aa  635    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 		 873 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 		 868 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  39.25 
 
 		 869 aa  637    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  38.28 
 
 		 867 aa  681    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  45.45 
 
 		 882 aa  667    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  38.44 
 
 		 932 aa  638    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 		 870 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 		 872 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 897 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  38.81 
 
 		 859 aa  631  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  36.29 
 
 		 863 aa  626  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  36.78 
 
 		 910 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 889 aa  626  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 		 910 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  39.9 
 
 		 869 aa  619  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 		 857 aa  618  1e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  39.23 
 
 		 872 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 		 881 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  40.82 
 
 		 855 aa  612  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 		 859 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.33 
 
 		 891 aa  610  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  38.69 
 
 		 892 aa  609  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 		 863 aa  608  9.999999999999999e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 871 aa  607  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 863 aa  609  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.66 
 
 		 855 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 		 930 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.48 
 
 		 862 aa  605  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 		 863 aa  605  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.39 
 
 		 853 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 		 881 aa  605  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 		 856 aa  605  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 		 865 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  39.9 
 
 		 874 aa  602  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 		 859 aa  602  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  39.09 
 
 		 856 aa  601  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  39.9 
 
 		 857 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  38.34 
 
 		 891 aa  597  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 882 aa  596  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  40.69 
 
 		 880 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  38.75 
 
 		 853 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  39.65 
 
 		 857 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  39.63 
 
 		 901 aa  598  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 857 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 896 aa  595  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  40.57 
 
 		 860 aa  594  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  35.22 
 
 		 872 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  38.28 
 
 		 855 aa  594  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  35.22 
 
 		 872 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  39.9 
 
 		 880 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 		 855 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  42.36 
 
 		 854 aa  592  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 823 aa  592  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  39.23 
 
 		 872 aa  591  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 888 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 		 861 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 		 878 aa  592  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 		 861 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 		 855 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 861 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  35.79 
 
 		 873 aa  586  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  38.9 
 
 		 872 aa  588  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 888 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 		 854 aa  588  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  36.53 
 
 		 858 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 		 862 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 		 861 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.04 
 
 		 856 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  39.44 
 
 		 854 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 		 854 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 		 874 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  38.69 
 
 		 871 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  38.77 
 
 		 863 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 		 856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 		 868 aa  585  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 859 aa  582  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  39.53 
 
 		 872 aa  581  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  39.6 
 
 		 850 aa  582  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 		 856 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 		 903 aa  579  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 		 854 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  38.94 
 
 		 882 aa  582  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 854 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>