More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2548 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2548  amidophosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 		 207 aa  401  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  55.39 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  54.41 
 
 		 235 aa  153  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  41.89 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  39.64 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  37.39 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  44.12 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.96 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  43.78 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  39.83 
 
 		 255 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  43.17 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  36.5 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  41.05 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  40.41 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  39.55 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  38.79 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  38.26 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  42.5 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 		 239 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  32.13 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  34.16 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  35.11 
 
 		 241 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  36.32 
 
 		 255 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  35.11 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 271 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  43.04 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 		 264 aa  95.9  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 		 232 aa  95.5  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  35.2 
 
 		 247 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  38.68 
 
 		 255 aa  95.1  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  34.21 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  36.4 
 
 		 255 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  38.3 
 
 		 267 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 		 270 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  37.87 
 
 		 279 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  34.35 
 
 		 245 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  29.78 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  33.99 
 
 		 236 aa  92  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  39.78 
 
 		 247 aa  91.7  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  40.44 
 
 		 241 aa  91.3  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  40.74 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  38.16 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  37.55 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  32.2 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  34.62 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 		 272 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  31.73 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  35.18 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.5 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  41.3 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  37.27 
 
 		 240 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  36.32 
 
 		 255 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  32.39 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  34.98 
 
 		 263 aa  88.6  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  34.98 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  31.86 
 
 		 229 aa  88.2  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 230 aa  88.2  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  32.23 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  40.2 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  31.78 
 
 		 246 aa  86.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  29.38 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  42.95 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  40.62 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  39.51 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.1 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.27 
 
 		 230 aa  85.9  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  37.44 
 
 		 250 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  31.41 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  35 
 
 		 249 aa  85.1  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  36.2 
 
 		 246 aa  85.1  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  38.19 
 
 		 242 aa  84.7  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  35.19 
 
 		 243 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  34.8 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  36.25 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  35.56 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  32.14 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  30.1 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  30.84 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  50 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  35.02 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  29.95 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  29.95 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  36.45 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  30.19 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  39.5 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>