More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1531 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  72.23 
 
 
493 aa  726    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
482 aa  983    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  72.23 
 
 
493 aa  720    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.23 
 
 
876 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  47.82 
 
 
483 aa  463  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.56 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  46.2 
 
 
481 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.45 
 
 
481 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  46.47 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.64 
 
 
484 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  45.65 
 
 
480 aa  435  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.21 
 
 
485 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.65 
 
 
494 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  43.59 
 
 
485 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0660  putative glycolate oxidase subunit GlcD  46.74 
 
 
483 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.883034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  45.22 
 
 
483 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  44.75 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.92 
 
 
495 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1700  putative glycolate oxidase subunit GlcD  45.61 
 
 
483 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  45.95 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.92 
 
 
495 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.52 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  45.16 
 
 
509 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06971  putative glycolate oxidase subunit glcD  44.35 
 
 
491 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  43.83 
 
 
489 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.01 
 
 
488 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.78 
 
 
488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.76 
 
 
488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.61 
 
 
497 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4799  FAD linked oxidase domain protein  44.66 
 
 
495 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.18 
 
 
493 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.51 
 
 
500 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.6 
 
 
496 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.36 
 
 
488 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  41.45 
 
 
499 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  41.45 
 
 
499 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.71 
 
 
890 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  43.87 
 
 
485 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.16 
 
 
497 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.46 
 
 
488 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  40.8 
 
 
484 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  40.72 
 
 
499 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.28 
 
 
459 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  41.28 
 
 
499 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  40.94 
 
 
499 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  41.81 
 
 
499 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  40.04 
 
 
497 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.62 
 
 
497 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  41.81 
 
 
499 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.37 
 
 
483 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 
497 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  41.37 
 
 
499 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.59 
 
 
499 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  41.59 
 
 
496 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  40.52 
 
 
495 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.15 
 
 
887 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  39.78 
 
 
497 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  40.85 
 
 
499 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  41.03 
 
 
503 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  41.59 
 
 
499 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  39.35 
 
 
497 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  40.38 
 
 
498 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  41.37 
 
 
499 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  41.59 
 
 
496 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  41.59 
 
 
496 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.54 
 
 
486 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  40.21 
 
 
499 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  40.43 
 
 
499 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 
499 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  41.15 
 
 
499 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  40.8 
 
 
499 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.17 
 
 
479 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  40.09 
 
 
499 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.23 
 
 
471 aa  371  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.21 
 
 
466 aa  369  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  40.43 
 
 
499 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.62 
 
 
498 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.62 
 
 
498 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  40.93 
 
 
499 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  40.56 
 
 
503 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  41.09 
 
 
477 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.28 
 
 
485 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.7 
 
 
497 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.13 
 
 
502 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  39.79 
 
 
499 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  40.09 
 
 
497 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  39.96 
 
 
500 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.09 
 
 
479 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  41.16 
 
 
499 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  41.14 
 
 
497 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.07 
 
 
490 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  40.21 
 
 
499 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.66 
 
 
501 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  38.41 
 
 
460 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  39.61 
 
 
497 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2754  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.87 
 
 
479 aa  363  3e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.7598  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  41.89 
 
 
499 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.93 
 
 
501 aa  362  8e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.97 
 
 
498 aa  362  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.09 
 
 
479 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.159289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>