206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1912 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 287 aa  585  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  46.34 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  43.21 
 
 		 256 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  44.69 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  42.81 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  31.94 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  33.45 
 
 		 258 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  29.87 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  28.76 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  26.96 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  40.2 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  26.98 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  27.38 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  26.07 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  35.4 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  31.67 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  20.86 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  22.41 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  22.32 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  29.92 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  32.17 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  25.11 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  24.26 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  29.63 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  32.74 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  25.17 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4088  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1057 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.475202  normal  0.216306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  22.36 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  22.67 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  22.67 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  27.59 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  25.58 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  27.19 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  27.14 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  27.19 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.34 
 
 		 1077 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  29.63 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  30.56 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  30.56 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  22.58 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  27.04 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  27.04 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  20.99 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  29.63 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  27.69 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  27.78 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  26.42 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  26.42 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  29.63 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  25.23 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  26.56 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  24.22 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  25.27 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  28.42 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  28.8 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  27.87 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  28.33 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  29.47 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  25.23 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  25.78 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  23.73 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  28.8 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  28.7 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  26.95 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  25.93 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  22.66 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  27.78 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  21.12 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  26.02 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  26.05 
 
 		 345 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  26.02 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  26.02 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  22.48 
 
 		 488 aa  52.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  26.87 
 
 		 249 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  26.87 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  26.87 
 
 		 249 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 249 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  22.48 
 
 		 488 aa  52.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  27.18 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>