More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8782 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 429 aa  819    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  38.79 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  35.22 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 451 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 426 aa  156  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 416 aa  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  33.51 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  35.67 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  33.85 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  31.77 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  31.77 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  31.77 
 
 		 418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  31.77 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  31.77 
 
 		 418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  32.28 
 
 		 397 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  36.36 
 
 		 289 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.74 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.48 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.48 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.48 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 405 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 425 aa  97.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 441 aa  96.3  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.43 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.06 
 
 		 408 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  21.92 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  21.92 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.35 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 415 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.97 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 439 aa  89.7  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  31.61 
 
 		 415 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  30.75 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  30.75 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  30.75 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.06 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.31 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  26.97 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.51 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.66 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  25.41 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  24.72 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  23.88 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  23.88 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  24.72 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  25.41 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  23 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>