More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8645 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
253 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  55.34 
 
 
252 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  57.92 
 
 
242 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4431  regulatory protein, DeoR  61.54 
 
 
194 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74821  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  48.4 
 
 
254 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  48.61 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4140  DeoR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
256 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  38.25 
 
 
253 aa  142  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.78 
 
 
250 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  40.62 
 
 
264 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  37.86 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.88 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  33.73 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  33.47 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  40.97 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  35.17 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.75 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  37.9 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  35 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  35 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  34.55 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  34.55 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  35.41 
 
 
257 aa  125  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  34.55 
 
 
250 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
253 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
250 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
250 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
250 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
250 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  34.27 
 
 
250 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  34.27 
 
 
250 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.77 
 
 
251 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.77 
 
 
251 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 
268 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  28.46 
 
 
258 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
248 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  33.33 
 
 
248 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  38.02 
 
 
264 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  31.3 
 
 
255 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
251 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  31.05 
 
 
252 aa  122  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  35.66 
 
 
258 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  33.6 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  36.9 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.32 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  32.19 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  36.19 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  33.2 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  33.2 
 
 
259 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1769  DeoR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
265 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.125805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.19 
 
 
251 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  33.2 
 
 
257 aa  119  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
257 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  33.2 
 
 
257 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
253 aa  118  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  33.2 
 
 
257 aa  119  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  35.18 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
254 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.65 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  32.39 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.65 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.06 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.06 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.06 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.06 
 
 
252 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2986  DeoR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.53 
 
 
257 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 
269 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.56 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  31.56 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  31.56 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.56 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.56 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.56 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.56 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.41 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.56 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.24 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.41 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>