59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8549 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 410 aa  825    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 524 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  40.96 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  36.64 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 403 aa  205  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 		 400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.08 
 
 		 401 aa  183  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  36.3 
 
 		 350 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  32.34 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  32.92 
 
 		 470 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 401 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 383 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  33.96 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  30.02 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  30.85 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  35.63 
 
 		 562 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 416 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  30.91 
 
 		 337 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  31.25 
 
 		 527 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.77 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  28.5 
 
 		 405 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  35.12 
 
 		 491 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  29.55 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  28.35 
 
 		 401 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  27.79 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  28.91 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  29.51 
 
 		 535 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  26.99 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  33.19 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  28.32 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  27.25 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  25.33 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 488 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  33.63 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  38.98 
 
 		 143 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 490 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>