More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6717 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  44.51 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  41.5 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 186 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 186 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  39.81 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  38.61 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  36.97 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  39.78 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  31.21 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  35.11 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>