76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4230 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  52.61 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  41.95 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  37.02 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  30.43 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  32.06 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  29.62 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  28.73 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  27.78 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  29.17 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  26.42 
 
 		 261 aa  88.6  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  26.87 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  26.34 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  28.57 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  27.68 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  21.2 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  23.13 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  28.74 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  29.3 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  30.28 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  39.13 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  21.61 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  33.33 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  30.13 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  36.84 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  33.87 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  30.28 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  23.14 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3206  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  37.68 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  25.97 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  36.23 
 
 		 332 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  35.62 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  30.91 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  33.72 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  37.68 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  33.72 
 
 		 338 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  25.71 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  36.23 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  37.68 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  38.89 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  37.68 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  34.78 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  28.44 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  30.43 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  34.74 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  21.86 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  36.23 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  21.72 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  36.96 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  34.78 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  36.23 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  34.72 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  31.88 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  33.33 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  30.34 
 
 		 286 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  36.11 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 285 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>