More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2704 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
145 aa  291  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  64.83 
 
 
144 aa  191  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  64.83 
 
 
140 aa  188  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  65 
 
 
142 aa  188  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  58.22 
 
 
142 aa  169  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  58.45 
 
 
137 aa  168  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  61.07 
 
 
143 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  59.42 
 
 
158 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  47.89 
 
 
149 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  47.71 
 
 
165 aa  126  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  42.67 
 
 
148 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  40.67 
 
 
144 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  41.79 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  41.26 
 
 
149 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  41.26 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7013  hypothetical protein  65.12 
 
 
253 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00663505  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  47.69 
 
 
163 aa  110  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  40.97 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  42.76 
 
 
143 aa  107  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
149 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
149 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
149 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  46.21 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.69 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  32.82 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  44.57 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  35.92 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.69 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.06 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  32.06 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  34.92 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0388  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865112  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  28.68 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.17 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  38.39 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  40.7 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  40.7 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  28.48 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  26.57 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 
147 aa  67  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  34.65 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  27.97 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  26.76 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  29.69 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  32.43 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  29.33 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  30.71 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  34.38 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0306  heat shock protein Hsp20  37 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  34.11 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  32.85 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  30.5 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  29.73 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  31.34 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  30.5 
 
 
147 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  32.05 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>